Кафедра факультетской педиатрии организована в ходе реструктуризации кафедр путем объединения кафедры педиатрии №1 и кафедры детских инфекций ГБОУ ВПО «Кубанский государственный медицинский университет» Минздравсоцразвития России с 1-го сентября 2011 года.
Кафедру возглавляет профессор д.м.н. Шашель Виктория Алексеевна. На кафедре работают 3 профессора д.м.н. (Шашель В.А., Назаретян В.Г., Биленко Н.П.), 1 профессор к.м.н. (Александрова О.К.), 5 доцентов к.м.н. (Баум Т.Г., Первишко О.В., Тхакушинова Н.Х., Шадрина Э.М., Щеголеватая Н.Н.), 1 ассистент д.м.н ( Бурлуцкая А.В.), 3 ассистента без степени (Левин П.В., Фирсова В.Н., Тетенкова А.А.).
На кафедре обучаются 9 аспирантов.
Преподавание ведется на II курсе педиатрического факультета (Уход за здоровыми и больными детьми), на III курсе педиатрического факультета (Пропедевтика детских болезней), на IV, V, VI курсах студентам медико-профилактического факультета (Педиатрия), на V курсе стоматологического факультета (Педиатрия), на VI курсе педиатрического факультета (Поликлиническая педиатрия и Детские инфекционные болезни), на лечебном факультете IV и V курсы (Детские инфекционные болезни).
Кроме того кафедра руководит летней производственной практикой на I, III и V курсах педиатрического факультета.
История кафедры факультетской педиатрии слагается из историй кафедр педиатрии №1 и кафедры детских инфекционных болезней.
Кафедра педиатрии №1 организована в 1972 году. С момента создания кафедры ее организатором и руководителем до 2008 года был доктор медицинских наук профессор В.П. Настенко. С 1975 по 1984 годы он являлся проректором по учебной работе Кубанского государственного медицинского института имени Красной армии. В 1995 году постановлением главы администрации ему было присвоено звание «Заслуженный деятель науки Кубани», а в 1999-м – звание «Заслуженный врач РФ».
Основной научной проблемой кафедры в 1980–1990 годах была санаторно-курортная реабилитация детей с заболеваниями органов дыхания и пищеварения. Ею также занимались сотрудники кафедры доцент к.м.н. В.А. Самаркин, доцент к.м.н. Н.П. Биленко и ассистент к.м.н. Т.В. Сундатова. Последние 10 лет научным направлением кафедры являются проблемы экологической педиатрии, вопросы влияния биоритмов организма родителей и ребенка на течение различных заболеваний у детей. Продолжается изучение санаторно-курортной реабилитации детей с заболеваниями органов пищеварения, дыхания, опорно-двигательного аппарата. По результатам научных исследований за последние 5 лет защищено 3 докторских и 5 кандидатских диссертаций. Выпущено 9 монографий, 13 методических пособий, 71 научная статья. По итогам выполненных научно-исследовательских работ получены почётные грамоты и награды регионального и российского уровней.
С 2008 года кафедру возглавляет д.м.н. профессор В.А. Шашель. В арсенале ее научной работы 225 статей, 15 монографий, 4 патента, 2 рационализаторских предложения и 3 авторских изобретения. В.А. Шашель является членом Ученого Совета КубГМУ, председателем Ученого Совета педиатрического факультета КубГМУ, членом диссертационного совета Д-208.098.01 при Ставропольской государственной медицинской академии, экспертом страховой медицинской компании «Сибирь», членом общественного экспертного совета при Уполномоченном по правам ребенка в Краснодарском крае, членом медицинского совета КубГМУ, членом комиссии департамента здравоохранения по разбору и предотвращению случаев младенческой и детской смертности, членом комиссии «О порядке получения квалификационных категорий специалистами с высшим образованием, работающими в системе здравоохранения Краснодарского края», членом правления общества детских врачей Краснодарского края, членом редколлегии «Медицина Северо-Запада». С 2008 года по настоящее время – деканом педиатрического факультета.
Всего за 38 лет существования кафедры подготовлено 4 доктора медицинских наук, 16 кандидатов наук, 20 аспирантов, 2 соискателя, 102 ординатора, 198 врача-интерна, обучено 125 практических врачей Краснодарского края.
Кафедра детских инфекций преобразована из курса детских инфекций (1973–1988 гг.). Основной клинической базой была и остается детская инфекционная больница г.Краснодара (ГУЗ «СКДИБ»), а также детская городская поликлиника №7, краевой детский санаторий «Тополёк».
С 1981 года до 2011 кафедрой детских инфекций заведовала к.м.н. профессор, главный детский инфекционист департамента здравоохранения Краснодарского края, Заслуженный работник здравоохранения Кубани О.К. Александрова.
Основным разделом работы кафедры являлась учебно-методическая, научная и лечебная работы. Сотрудники активно работали в различных учебных, методических комиссиях КГМУ. На кафедре защищены 3 кандидатские диссертации по детским инфекционным болезням (О.В. Бевзенко, А.Г. Лисицина, Л.В. Дубова). В настоящее время обучение заканчивает очный аспирант А.А. Тетенкова, которая продолжила выполнение основного фрагмента комплексной темы кафедры «Цитокиновый профиль при инфекционных заболеваниях у детей». Результаты научных исследований получили своё отражение в изданных научных публикациях в ведущих сборниках и журналах. За последние 5 лет сотрудники кафедры опубликовали 58 печатных работ, 12 учебных пособий и 1 методическую рекомендацию для студентов и врачей-педиатров регионального и федерального уровня.
Сотрудниками кафедры факультетской педиатрии активно проводится лечебная работа на учебных базах, работа в краевых комиссиях по вакцинопрофилактике, разбору причин младенческой смертности, консультирование больных с инфекционной патологией г.Краснодара и Краснодарского края.