Кафедра оперативной хирургии и топографической анатомии была организована в 1923 году. Номинальное заведование принял на себя профессор Николай Федотович Мельников-Разведенков – ректор института. Лекции читали доктора В.И. Юргелевич, П.Е. Никишин и И.И. Ефет. В 1925 году зав.кафедрой оперативной хирургии и топографической анатомии был избран Георгий Николаевич Лукьянов.
В 1935 году кафедру возглавил профессор Иван Петрович Дмитриев, который разработал методику пальцевого расширения суженного левого атриовентрикулярного отверстия при митральном стенозе (1926 г.).
В 1944 году заведующим стал кандидат медицинских наук, хирург действующей армии В.К. Красовитов. Штат кафедры состоял из зав.кафедрой, ассистентов В.И. Юргелевича и А.И. Мамаенко, лаборанта Е.С. Соколовой. В 1946 году ассистентами приняты демобилизовавшиеся В.Н. Пинчук и Б.Н. Бойчук. В 1947 году В.К. Красовитовым подготовлена и издана первая монография «Первичная пластика отторгнутыми лоскутами кожи», которая была удостоена премии НКЗ СССР. В тяжёлые послевоенные годы ассистент Б.Н. Бойчук выполнил и защитил кандидатскую диссертацию на тему «Закрытая свободная костная пластика» (1953 г.). На материалах докторской диссертации В.К. Красовитова в 1956 и 1958 годах были изданы две монографии, за одну из них – «Отдаленные результаты огнестрельных повреждений тазобедренного сустава» Президиум Академии медицинских наук СССР присудил в 1960 году профессору В.К. Красовитову премию имени Н.Н. Бурденко.
В 1973 году кафедру оперативной хирургии и топографической анатомии возглавил О.В. Дубинкин. Он стал автором 84 научных публикаций, под его руководством защищены 4 кандидатских и одна докторская диссертации. Эрудиция и организаторский талант О.В. Дубинкина позволили ему быть членом Специализированного хирургического совета ВАКа СССР и Российской Федерации, председателем Специализированного совета по защите кандидатских и докторских диссертаций. Он был награжден знаком «Отличник здравоохранения».
В 1998 году кафедру возглавил д.м.н., профессор Э.А. Петросян, заслуженный изобретатель РФ. Ему принадлежит приоритет в разработке теории электрохимического окисления крови и механизма преодоления антибиотикорезистентности микроорганизмов. Материалы его докторской диссертации легли в основу получения в 1991 году разрешения Фармкомитетом РФ применения натрия гипохлорита. В 1995 году Э.А. Петросян удостоен премии правительства РФ в области науки и техники. Его исследования поддерживались грантами Российского фонда фундаментальных исследований. Профессор Э.А. Петросян является автором и соавтором 438 публикаций, 38 патентов, 3 монографий, 6 учебников и 15 учебно-методических пособий. Под его руководством защищены 5 докторских и 26 кандидатских диссертаций.
Кафедрой подготовлен и издан двухтомный учебник «Оперативная хирургия и топографическая анатомия», выдержавший четыре переиздания.
С 2012 года кафедру возглавляет декан лечебного факультета университета кандидат медицинских наук А.А. Сухинин. На кафедре работают: профессор к.м.н. В.В. Сапсай, профессор д.м.н О.А. Терещенко, доцент к.м.н. Г.В. Никитина, ассистенты, к.м.н. А.Э. Погосян, к.м.н. В.В. Малышко, к.м.н. И.Ю. Цымбалюк, Я.В. Фомина, Е.А. Гутовская, М.И. Богрова, А.А. Куликова, Г.Н. Ванян, старший лаборант Л.М. Соловьёва, старший лаборант С.В. Мульский, лаборант В.В. Аладьина.